Oxford Nanopore, Cara LIPI Baca Sekuens Genom Corona di RI

Oleh -

 

Lembaga Ilmu Pengetahuan Indonesia (LIPI) mengklaim telah mengurutkan sekuens genom utuh atau Whole Genome Sequencing (WGS) dari dua sampel virus SARS-CoV-2 penyebab Covid-19 dari Indonesia.

Kepala Laboratorium Biosafety Level-3 Pusat Penelitian Bioteknologi LIPI, Ratih Asmana Ningrum, menyatakan, pihaknya menggunakan teknologi Oxford Nanopore untuk melakukan sekuens genom sampel virus itu.

"Kami menggunakan platform oxford nanopore technology. Untuk data virus SARS CoV-2 asal Indonesia, kami yang pertama menggunakan teknologi ini di Indonesia," ujar Ratih

Minggu (30/8).

Ratna menuturkan Oxford Nanopore menggunakan prinsip kerja lubang berskala nano. Perangkat itu melewatkan arus ionik melalui pori-pori nano dan mengukur perubahan arus saat molekul biologis melewati pori-pori tersebut.

Informasi tentang perubahan arus, kata Ratih, kemudian dapat digunakan untuk mengidentifikasi molekul.

"Jika untai DNA dilewatkan melalui nanopore, terjadi perubahan arus saat basa G, A, T dan C melewati pori dalam kombinasi yang berbeda," ujarnya.

Ratih berkata pengukuran arus tersebut menjadi dasar penentuan urutan basa dalam suatu sekuens. Namun, dia tetap menegaskan diperlukan pengolahan data secara bertahap sehingga dapat diperoleh urutan genom lengkap dari suatu organisme.

Ratih menambahkan teknologi Oxford Nanopore memiliki banyak keunggulan, antara lain waktu pengerjaan cepat dan fleksibel, instrumen bersifat portabel dan berukuran mini, serta harga instrumen rendah. Meski begitu dia menyebut penggunaan platform itu masih sangat terbatas.

"Salah satu faktor pembatasnya adalah kurangnya sumber daya manusia yang terampil dalam menggunakan teknologi tersebut," ujar Ratih.

Terkait masalah itu, LIPI mendorong penguasaan teknologi tersebut untuk membantu menghasilkan data genom virus SARS-CoV-2 lebih cepat sehingga Indonesia memiliki lebih banyak informasi genom virus yang sangat dibutuhkan pada masa pandemi ini.

Sebelumnya LIPI berhasil mengurutkan sekuens genom utuh dua sampel virus SARS-CoV-2 penyebab Covid-19 dari Indonesia. Hasil sekuens itu telah diunggah ke Global Initiative on Sharing All Influenza Data (GISAID), lembaga bank data yang saat ini menjadi acuan untuk data genom virus SARS-CoV-2, pada Selasa (25/8).

Peneliti Pusat Penelitian Bioteknologi LIPI Anggia Prasetyoputri mengatakan, SARS-CoV-2 merupakan virus yang memiliki materi genetik. Sehingga virus itu memiliki kemungkinan untuk mengalami perubahan atau mampu bermutasi dengan cepat.

Selain LIPI, LBM Eijkman dan Universitas AIrlangga juga telah berhasil mengurutkan sekuens genom utuh sampel virus SARS-CoV-2 penyebab Covid-19 dari Indonesia. Mereka juga sudah mengirim hasilnya ke GISAID.

Komentar

Posting Komentar

Postingan populer dari blog ini

Ide Trading dari CGS International Sekuritas: BBRI, BBNI, EXCL, VKTR, INCO, PTPP

Oleh -
  Indeks Harga Saham Gabungan (IHSG) berpotensi untuk melemah. Adapun IHSG melemah 0,40% atau turun 29,28 poin ke posisi 7.247,46 pada perdagangan Selasa (5/3).   Tim Retail Research CGS International Sekuritas memaparkan terkoreksinya indeks di bursa Wall Street dan berlanjutnya aksi jual investor asing diprediksi akan menjadi sentimen negatif di pasar. "Sementara itu pengumuman rencana pembagian dividen dari emiten dan berlanjutnya rally harga batubara berpeluang menjadi sentimen positif,," tulisnya dalam riset, Rabu (6/3). CGS International Sekuritas memproyeksikan IHSG akan bergerak bervariasi cenderung melemah dengan kisaran support 7.200 atau 7.155 dan resistance di level 7.285 atau 7.340. Berikut rekomendasi saham untuk trading pada Rabu (6/3) dari CGS International Sekuritas. 1. PT Bank Rakyat Indonesia Tbk (BBRI) Speculative buy dengan support Rp 6.000. Cut loss jika break di bawah Rp 5.875. Jika tidak break di bawah Rp 6.000, ...
Baca selengkapnya

Proyeksi IHSG & Rekomendasi Saham BNGA, EXCL, BMRI, dan BKSL Untuk Rabu

Oleh -
 . Indeks Harga Saham Gabungan (IHSG) menguat 0,02% atau 1,49 poin ke level 7.285,32 hingga akhir perdagangan di Bursa Efek Indonesia (BEI), Selasa (27/2).   Pengamat Pasar Modal & Founder WH-Project William Hartanto memproyeksikan IHSG berpotensi cenderung menguat di kisaran 7.275–7.295 pada perdagangan Rabu (28/2).   William menyebut, faktor teknikal yang membuat IHSG berpotensi bergerak menguat pada hari ini yaitu, karena pertahanan level 7.275 tampak berhasil. Posisi IHSG di atas MA20 sehingga membuka peluang penguatan hari ini. Terjadi kenaikan volume dan nilai transaksi pada saat IHSG menguat. Ini menunjukkan dorongan beli yang kuat sudah mendominasi pasar.   “Sementara untuk sentimen belum ada yang perlu diperhatikan sampai saat ini,” kata William dalam risetnya, Selasa (27/2). 1. Bank CIMB Niaga Tbk (BNGA) Analisa: Trend following dengan posisi candlestick menguat di atas MA5 dan MA20. •    Rekomendasi: Buy •    Support: Rp 2...
Baca selengkapnya

BRI Life Menerima 4 Penghargaan dari 3 Institusi,Cetak Kinerja Positif Sepanjang 2023

Oleh -
  Konsistensi PT. Asuransi BRI Life dalam menawarkan produk dan layanan asuransi jiwa yang berkualitas kepada nasabah kembali mendapatkan apresiasi. Pencapaian ini tak lepas dari kontribusi BRI Life untuk fokus dalam menjalankan strategi dan integritas dalam mewujudkan visi dan misi perusahaan. Beberapa penghargaan yang diterima BRI Life di paruh tahun 2024 ini antara lain, penghargaan sebagai “Life Insurance Market Leaders 2024” yang berikan oleh Media Asuransi, dalam acara Penganugerahan Insurance Market Leaders Award di Jakarta (30/7). Tahun ini Lembaga Riset Media Asuransi dalam melakukan kajian masih tetap sama, yakni menggunakan 9 indikator keuangan dari laporan keuangan publikasi perusahaan per 31 Desember 2023. Yakni, pendapatan premi, pendapatan premi neto, klaim dan manfaat dibayar, beban klaim dan manfaat dibayar, investasi, hasil investasi, ekuitas, aset, dan laba/rugi setelah pajak Dalam kesempatan terpisah, Direktur Utama BRI Life Aris Hartanto mengucapkan ter...
Baca selengkapnya